С 1915 года Гидрохимическим институтом выпущено 133 тома сборника «Гидрохимические материалы», в которых опубликованы результаты оригинальных исследований, проведенных сотрудниками института и других учреждений по различным аспектам гидрохимии и экологии.
В ГХИ с 1968 года подготавливаются и издаются Ежегодники «Качество поверхностных вод Российской Федерации», а с 2010 года выпускаются и Приложения к Ежегоднику «Информация о наиболее загрязненных водных объектах Российской Федерации».
Сотрудниками института опубликовано свыше 2500 тысяч статей в отечественных и зарубежных изданиях, опубликовано свыше 60 монографий, учебников, учебных пособий, справочников.
В обменно-резервном фонде научной библиотеке ГХИ можно приобрести подготовленные сотрудниками института монографии, учебники, справочники, сборники статей и материалов конференций.